어떤 네트워크가 유지되어야
효소가 최소 기능을 갖는가?
개별 변이 병원성의 독립 평가를 넘어, 구조 상호작용 네트워크와 기능 구조(competence)로 질문을 옮긴다.
1. 성공 정의
| 약함 | IDSX |
|---|---|
| 어떤 변이에 붙일까? | 어떤 네트워크를 유지·보강할까? |
| docking / affinity | 구조 상태 → ER 통과 → competence |
| hotspot = 결합 자리 | module node ≠ surface patch ≠ RF interface set |
| Tm만 올리면 성공 | Tm은 대리 지표 · 목표는 리소좀 기능 |
D2S0: binding ≠ catalytic competence.
2. Continuum 가설
임상 의미는 “어떤 변이가 있는가”만이 아니라 기능에 필요한 네트워크가 얼마나 남았는가와 관련될 수 있다. 고기여 구조 노드 손상 → 접힘·QC 불리 → 중증 쪽 기울 수 있음. 저기여 표면 → 잔존 여지.
3. 활성부위 · 코어 · 표면
| 층 | 역할 | 개입 |
|---|---|---|
| Active / interaction chemistry | 촉매·기질 | Hard EXCLUDE / CAUTION (억제 위험) |
| Core / structural module | 접힘·패킹·H-bond | 문제 정의의 중심 |
| Surface patch | 접근 가능 | 개입 적용 (바인더·알로스테릭) |
“기능 이상 = 곧 active site” 오인을 피한다. 많은 병원성 미스센스는 코어 불안정이다. 재변형·샤페론의 키는 활성부위 흉내가 아니라 네트워크가 다시 서게 하는 것일 수 있다.
4. ER 품질관리 (서열을 읽지 않는다)
ERQC는 ‘152=I’를 스캔하지 않는다. 접힘 상태, 노출 소수성, N-당쇄 코드, calnexin/BiP 점유를 본다. 변이는 그 상태를 바꿔 통과/저류/ERAD를 가르는 원인이다.
따라서 “interaction network를 유지하면 ER 통과에 긍정적일 수 있다”는 프레임의 중심 가설이다. AF에서 fold가 비슷해도 수율·중간체만으로 QC에 걸릴 수 있다.
5. 목표 계층 — 열안정은 온도계
↑ 세포: ER 통과 · 배달 · ERAD↓
↑ 분자: 네트워크 / 기능 구조 유지
↑ 대리: Tm · ΔΔG · 발현 · 국재 · KD
프로젝트를 “열적 안정성 보장 인자 탐색”으로 부르지 않는다. 암브록솔도 ER 안정화→트래픽킹→활성 서사이며, 열저항은 그 측정 축 중 하나다.
6. 개입 원칙
- 모듈 정의 (누가 누구와, 어떤 물리로)
- 매장 노드 비결합 · 연결 표면 지정
- 검증: 결합 → (가능 시) 안정/발현 → competence