Worked example · not the whole project

구조 모듈 사례:
Ser152 네트워크

프레임을 한 코어 노드에 적용한 사례다. Ser152 / p.Ser152Ile은 “IDS 유일 열쇠”가 아니라 TIER1 구제 논리를 설명하기 좋은 대표 얼굴이다.

구조 잔기 · 비촉매 5FQL 기하 ClinVar Pathogenic 직접 결합 불가 (매장)

1. 왜 사례로 적합한가

기준값함의
촉매 거리~10.3 Å직접 화학 파괴 스토리 약함
RSA0%접힌 상태 직접 바인딩 불가
물리OH···Asp148 / Thr118H-bond 네트워크 노드
S→I부피·소수성↑패킹·극성 교란
반례Arg88 (2.77 Å)빈도≠구제적합
focusing의 의미: 문제 = 152 모듈 · 적용 = 연결된 표면 패치. (Asp308·Tyr108도 형제 사례 — 2축 맵)

2. 기전 계층

1차 (5FQL): 부피 충돌 + H-bond 상실 + 극성 불일치 → 모듈 불안정.

2차 (클래스): 접힘 수율·중간체 불리 → ERQC (서열 판독 아님) → 전달↓ / ERAD 가능.

종점: 리소좀 기능 분자↓ → 측정 활성↓.

1차로 밀지 않음: 직접 촉매 파괴 · 전하 플립 · 장거리 알로스테리 단독.

AF상 backbone이 WT와 비슷해도 모순 아님: 미묘한 모듈 불안정만으로도 QC·배달이 깨질 수 있다. 네트워크를 유지하면 ER 통과에 긍정적일 수 있다 — 실측 전 가설.

시각화

cascade
Fig 1. 인과 cascade (S 구조 · C 클래스 · H 가설).
ranking
Fig 2. 기전 개연성 순위.
pipeline
Fig 3. 공장(ER) → QC → 폐기·배달 실패 비유.
2axis
Fig 4. 촉매 거리 × 네트워크 중요도. Ser152 = rescue-logic 구역 대표점.

3. 비전문가 한 줄

“칼날(촉매)이 부러졌다”기보다 “조립 공장에서 수율이 떨어져 폐기·미배달”에 가깝다고 읽을 구조적 이유가 있다. 개인 중증도는 임상 영역.

4. 이 페이지가 아닌 것

계산 · 종합